Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Phf11cB4XVP9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Phf11cB4XVP9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms