Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC6

Polr3a, DNA-directed RNA polymerase subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3aB2RXC6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Polr3aB2RXC6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Polr3aB2RXC6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms