Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cspp1B2RX88 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cspp1B2RX88 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms