Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Apba1B2RUJ5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apba1B2RUJ5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms