Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Znf518aB2RRF6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Znf518aB2RRF6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Znf518aB2RRF6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Znf518aB2RRF6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Znf518aB2RRF6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Znf518aB2RRF6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Znf518aB2RRF6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Znf518aB2RRF6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Znf518aB2RRF6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Znf518aB2RRF6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Znf518aB2RRF6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Znf518aB2RRF6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Znf518aB2RRF6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Znf518aB2RRF6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Znf518aB2RRF6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Znf518aB2RRF6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Znf518aB2RRF6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Znf518aB2RRF6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Znf518aB2RRF6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Znf518aB2RRF6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Znf518aB2RRF6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Znf518aB2RRF6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Znf518aB2RRF6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Znf518aB2RRF6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Znf518aB2RRF6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Znf518aB2RRF6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Znf518aB2RRF6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Znf518aB2RRF6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Znf518aB2RRF6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Znf518aB2RRF6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Znf518aB2RRF6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms