Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn7aB1AYL1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn7aB1AYL1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms