Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prr29B1ARI9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prr29B1ARI9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms