Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprsB0V2N1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprsB0V2N1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprsB0V2N1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprsB0V2N1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprsB0V2N1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprsB0V2N1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PtprsB0V2N1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PtprsB0V2N1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PtprsB0V2N1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PtprsB0V2N1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PtprsB0V2N1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprsB0V2N1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms