Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2-M5A7VMS3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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