Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Atp8b5A3FIN4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Atp8b5A3FIN4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp8b5A3FIN4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atp8b5A3FIN4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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