Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CatsperbA2RTF1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CatsperbA2RTF1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms