Protein–RNA interactions for Protein: A2ASQ1

Agrn, Agrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrnA2ASQ1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AgrnA2ASQ1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AgrnA2ASQ1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AgrnA2ASQ1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AgrnA2ASQ1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AgrnA2ASQ1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AgrnA2ASQ1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AgrnA2ASQ1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AgrnA2ASQ1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AgrnA2ASQ1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AgrnA2ASQ1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AgrnA2ASQ1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms