Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pramef17A2ASJ1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms