Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tubb1A2AQ07 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms