Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC30.57■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Frmpd1A2AKB4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Frmpd1A2AKB4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Frmpd1A2AKB4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms