Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Frmpd4A2AFR3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Frmpd4A2AFR3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Frmpd4A2AFR3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms