Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtprfA2A8L5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprfA2A8L5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtprfA2A8L5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms