Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SVU1

Gm7298, Predicted gene 7298, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7298A0A0N4SVU1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gm7298A0A0N4SVU1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gm7298A0A0N4SVU1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gm7298A0A0N4SVU1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm7298A0A0N4SVU1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm7298A0A0N4SVU1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm7298A0A0N4SVU1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm7298A0A0N4SVU1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm7298A0A0N4SVU1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm7298A0A0N4SVU1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm7298A0A0N4SVU1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gm7298A0A0N4SVU1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gm7298A0A0N4SVU1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gm7298A0A0N4SVU1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gm7298A0A0N4SVU1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Gm7298A0A0N4SVU1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gm7298A0A0N4SVU1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm7298A0A0N4SVU1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm7298A0A0N4SVU1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm7298A0A0N4SVU1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm7298A0A0N4SVU1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm7298A0A0N4SVU1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm7298A0A0N4SVU1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm7298A0A0N4SVU1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm7298A0A0N4SVU1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm7298A0A0N4SVU1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm7298A0A0N4SVU1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm7298A0A0N4SVU1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm7298A0A0N4SVU1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm7298A0A0N4SVU1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.6 ms