Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Vmn1r89-201ENSMUST00000053008 951 ntAPPRIS P2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm28735-202ENSMUST00000188159 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm29457-201ENSMUST00000188224 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm28236-203ENSMUST00000188311 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm29070-202ENSMUST00000188541 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm28545-201ENSMUST00000188667 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm29616-201ENSMUST00000188777 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm29162-202ENSMUST00000188893 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm29338-201ENSMUST00000189318 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm28454-203ENSMUST00000190183 1495 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm28842-202ENSMUST00000190289 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm28318-203ENSMUST00000190347 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm28633-202ENSMUST00000190867 1485 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm29182-202ENSMUST00000191008 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm28632-202ENSMUST00000191193 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm28245-203ENSMUST00000191551 1495 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm38370-201ENSMUST00000192545 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm37462-201ENSMUST00000193386 1498 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Chmp4bQ9D8B3 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Chmp4bQ9D8B3 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Chmp4bQ9D8B3 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Chmp4bQ9D8B3 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Chmp4bQ9D8B3 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Chmp4bQ9D8B3 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Chmp4bQ9D8B3 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Chmp4bQ9D8B3 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Chmp4bQ9D8B3 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chmp4bQ9D8B3 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chmp4bQ9D8B3 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Chmp4bQ9D8B3 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Chmp4bQ9D8B3 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chmp4bQ9D8B3 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chmp4bQ9D8B3 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chmp4bQ9D8B3 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chmp4bQ9D8B3 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chmp4bQ9D8B3 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chmp4bQ9D8B3 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chmp4bQ9D8B3 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chmp4bQ9D8B3 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Chmp4bQ9D8B3 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chmp4bQ9D8B3 Vmn1r123-201ENSMUST00000166948 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chmp4bQ9D8B3 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chmp4bQ9D8B3 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Chmp4bQ9D8B3 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chmp4bQ9D8B3 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chmp4bQ9D8B3 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Chmp4bQ9D8B3 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chmp4bQ9D8B3 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Chmp4bQ9D8B3 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Chmp4bQ9D8B3 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms