Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Wwp1-201ENSMUST00000035982 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm12800-201ENSMUST00000075999 1455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Rprd1bQ9CSU0 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
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