Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
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PtprtQ99M80 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC8.79□□□□□ -1
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PtprtQ99M80 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC8.79□□□□□ -1
PtprtQ99M80 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
PtprtQ99M80 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PtprtQ99M80 AC125543.1-201ENSMUST00000222778 101 ntBASIC8.79□□□□□ -1
PtprtQ99M80 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PtprtQ99M80 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PtprtQ99M80 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PtprtQ99M80 Ccdc187-203ENSMUST00000227200 9528 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.79□□□□□ -1
PtprtQ99M80 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PtprtQ99M80 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC8.79□□□□□ -1
PtprtQ99M80 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
PtprtQ99M80 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
PtprtQ99M80 Itsn1-208ENSMUST00000114002 14012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
PtprtQ99M80 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
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PtprtQ99M80 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC8.78□□□□□ -1
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PtprtQ99M80 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
PtprtQ99M80 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PtprtQ99M80 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PtprtQ99M80 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
PtprtQ99M80 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
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PtprtQ99M80 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
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PtprtQ99M80 Iglv2-201ENSMUST00000103752 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.77□□□□□ -1
PtprtQ99M80 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
PtprtQ99M80 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC8.77□□□□□ -1
PtprtQ99M80 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC8.77□□□□□ -1
PtprtQ99M80 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1
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PtprtQ99M80 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
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PtprtQ99M80 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
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PtprtQ99M80 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
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PtprtQ99M80 Gm18442-201ENSMUST00000220925 639 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
PtprtQ99M80 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
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