Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Gm37830-201ENSMUST00000195282 837 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC5.77□□□□□ -1.48
Pacsin3Q99JB8 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r-ps62-201ENSMUST00000173275 910 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Pacsin3Q99JB8 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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