Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm5447-201ENSMUST00000070258 1773 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm13501-201ENSMUST00000118477 979 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm14549-201ENSMUST00000154993 1035 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm24211-201ENSMUST00000158264 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm8693-201ENSMUST00000178871 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm3496-201ENSMUST00000188283 745 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm42976-201ENSMUST00000200313 222 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 AC125523.1-201ENSMUST00000228018 934 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Tas2r136-201ENSMUST00000065532 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm12667-201ENSMUST00000118299 1332 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm12288-201ENSMUST00000121054 1282 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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