Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm38574-201ENSMUST00000211855 640 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Atg4aQ8C9S8 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Atg4aQ8C9S8 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms