Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19124-201ENSMUST00000191041 832 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr228-202ENSMUST00000217292 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms