Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Fxyd1-210ENSMUST00000206012 501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm44650-201ENSMUST00000206929 194 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm10764-202ENSMUST00000220397 2335 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 AC137961.1-201ENSMUST00000227924 734 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 AC105407.2-205ENSMUST00000224680 2733 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm43793-201ENSMUST00000201645 1333 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm42615-201ENSMUST00000197704 1820 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm12755-201ENSMUST00000122297 282 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm22613-201ENSMUST00000122679 292 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm9376-201ENSMUST00000171107 729 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Fbln5-201ENSMUST00000021603 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Zfp521-201ENSMUST00000025288 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Med12l-204ENSMUST00000164225 10264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Cntn1-204ENSMUST00000169825 5671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 9530036M11Rik-201ENSMUST00000138767 1996 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Prickle2-204ENSMUST00000113447 7679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Olfr119-202ENSMUST00000213732 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Ctnnd1-222ENSMUST00000111696 6281 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Pi4ka-201ENSMUST00000036161 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm26140-201ENSMUST00000103807 110 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NipblQ6KCD5 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms