Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm22600-201ENSMUST00000157598 269 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm36638-201ENSMUST00000193295 400 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Vmn1r5-203ENSMUST00000228276 3188 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Q3U6N9 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Q3U6N9 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms