Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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VdrP48281 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Oosp1-203ENSMUST00000186557 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm37392-201ENSMUST00000192098 516 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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VdrP48281 Gm31305-201ENSMUST00000198557 710 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm9655-201ENSMUST00000211321 1284 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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VdrP48281 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 CT009556.3-201ENSMUST00000226173 513 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Rbp7-201ENSMUST00000030848 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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VdrP48281 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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VdrP48281 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Mc2r-201ENSMUST00000052347 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm17308-201ENSMUST00000181749 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VdrP48281 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
VdrP48281 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
VdrP48281 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
VdrP48281 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
VdrP48281 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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VdrP48281 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
VdrP48281 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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VdrP48281 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
VdrP48281 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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VdrP48281 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
VdrP48281 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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VdrP48281 Gm15533-201ENSMUST00000126205 465 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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VdrP48281 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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VdrP48281 Hspe1-ps1-201ENSMUST00000222955 330 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
VdrP48281 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
VdrP48281 AC157650.2-201ENSMUST00000224666 328 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
VdrP48281 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
VdrP48281 Mgat4d-201ENSMUST00000038692 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm5815-201ENSMUST00000050706 1185 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
VdrP48281 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
VdrP48281 Gm16391-201ENSMUST00000086601 447 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
VdrP48281 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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