Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm25557-201ENSMUST00000158084 315 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SrprbP47758 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SrprbP47758 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm3333-202ENSMUST00000221763 1044 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SrprbP47758 AC154618.2-201ENSMUST00000228299 452 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SrprbP47758 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm8569-201ENSMUST00000117630 647 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Ppp1r2-ps9-201ENSMUST00000173100 549 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm37543-201ENSMUST00000192443 1031 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Igkv15-101-1-201ENSMUST00000196661 258 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 AC122905.1-201ENSMUST00000218181 456 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 AC117656.3-205ENSMUST00000224606 1205 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 AC154184.2-201ENSMUST00000225335 349 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Olfr205-201ENSMUST00000074125 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Olfr344-201ENSMUST00000075474 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm22575-201ENSMUST00000082981 110 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Mir365-2-201ENSMUST00000083555 112 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SrprbP47758 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
SrprbP47758 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
SrprbP47758 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SrprbP47758 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
SrprbP47758 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
SrprbP47758 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms