Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn23Q9D7D7 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn23Q9D7D7 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn23Q9D7D7 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn23Q9D7D7 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn23Q9D7D7 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn23Q9D7D7 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn23Q9D7D7 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn23Q9D7D7 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn23Q9D7D7 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn23Q9D7D7 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn23Q9D7D7 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn23Q9D7D7 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn23Q9D7D7 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn23Q9D7D7 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn23Q9D7D7 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn23Q9D7D7 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn23Q9D7D7 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn23Q9D7D7 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn23Q9D7D7 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn23Q9D7D7 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Cldn23Q9D7D7 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn23Q9D7D7 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms