Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Sdr16c6-201ENSMUST00000095151 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Atg3Q9CPX6 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Vmn1r123-201ENSMUST00000166948 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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Atg3Q9CPX6 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 n-R5s161-201ENSMUST00000083728 114 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Atg3Q9CPX6 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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