Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm13815-201ENSMUST00000119963 412 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm15218-201ENSMUST00000131006 618 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm23385-201ENSMUST00000158592 295 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm7418-201ENSMUST00000162120 801 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Nedd8-202ENSMUST00000163750 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 1810007C17Rik-201ENSMUST00000187665 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm7496-201ENSMUST00000192573 1034 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm32975-201ENSMUST00000211651 584 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 AC156504.1-201ENSMUST00000214608 157 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Mbd3l1-203ENSMUST00000215255 708 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 RMST_1.1-203ENSMUST00000217866 775 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Olfr477-201ENSMUST00000091605 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm11823-201ENSMUST00000130582 2278 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Olfr987-202ENSMUST00000111598 1418 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm4596-201ENSMUST00000117197 442 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm8624-201ENSMUST00000118083 432 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ubxn4Q8VCH8 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms