Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Vmn1r123-201ENSMUST00000166948 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Etl4-206ENSMUST00000114608 6635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Olfr1261-203ENSMUST00000213909 2912 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm8995-202ENSMUST00000208417 3490 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Olfr1189-202ENSMUST00000213679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm14783-201ENSMUST00000118900 663 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm14037-201ENSMUST00000120576 313 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm37209-201ENSMUST00000194109 1276 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 6030400A10Rik-201ENSMUST00000199734 1212 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Exoc4-201ENSMUST00000052266 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Ikbkg-201ENSMUST00000004330 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Vezt-201ENSMUST00000047711 4479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm44009-201ENSMUST00000203539 521 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm42583-201ENSMUST00000202678 6700 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Lpp-201ENSMUST00000038053 15647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 AC168881.1-201ENSMUST00000226018 430 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 AC102603.1-201ENSMUST00000227481 584 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Olfr1205-201ENSMUST00000076438 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 AC117570.1-201ENSMUST00000214015 1886 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Rab8b-201ENSMUST00000041139 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm42837-201ENSMUST00000197071 2829 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Zrsr1-201ENSMUST00000049506 3282 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Rps11-ps3-201ENSMUST00000117608 486 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NipblQ6KCD5 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
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