Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.4
Trim71Q1PSW8 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Olfr1353-201ENSMUST00000039718 1992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Rfpl4b-201ENSMUST00000179279 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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