Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Pkp1P97350 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Pkp1P97350 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms