Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 AC160962.1-203ENSMUST00000225167 1105 ntAPPRIS P5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Vmn2r-ps100-201ENSMUST00000221238 1702 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 4930431P03Rik-202ENSMUST00000166127 4237 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm17937-201ENSMUST00000197908 742 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Hoxc11P31313 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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