Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Dnah12-202ENSMUST00000073309 611 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Scn11a-201ENSMUST00000070617 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Ppp1r7-201ENSMUST00000027494 10315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Lars-201ENSMUST00000097590 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Cep170-215ENSMUST00000195717 6967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Akap2-206ENSMUST00000107598 6830 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Slc4a8-201ENSMUST00000023776 11790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm21816-201ENSMUST00000179255 360 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Mir7074-201ENSMUST00000183884 63 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm9655-201ENSMUST00000211321 1284 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprmP28828 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprmP28828 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprmP28828 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprmP28828 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprmP28828 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Cfap57-201ENSMUST00000071972 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Olfr313-202ENSMUST00000217506 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm4852-201ENSMUST00000121202 729 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Mir6410-201ENSMUST00000184204 104 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Satb1-213ENSMUST00000169480 6194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Ctnnd1-208ENSMUST00000111677 5789 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Magea9-ps-201ENSMUST00000140655 732 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 Magea9-ps-202ENSMUST00000167328 899 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprmP28828 9930111H07Rik-201ENSMUST00000187270 821 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
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