Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm20832-201ENSMUST00000189076 665 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm30638-201ENSMUST00000195570 656 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm36728-201ENSMUST00000195782 665 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 AC153561.1-201ENSMUST00000215943 469 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Olfr1301-201ENSMUST00000080094 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm5185-201ENSMUST00000080271 619 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm23846-201ENSMUST00000083835 107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm25189-201ENSMUST00000083911 164 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Ftx-203ENSMUST00000130063 4275 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Slc51a-201ENSMUST00000042042 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 AC156645.1-201ENSMUST00000223066 5194 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Mphosph9-211ENSMUST00000184951 5008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 St8sia4-201ENSMUST00000043336 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm16015-201ENSMUST00000154897 390 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Obox4-ps31-201ENSMUST00000177210 1137 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm21518-201ENSMUST00000178115 567 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm20736-201ENSMUST00000178198 567 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm20843-201ENSMUST00000178505 567 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm21209-201ENSMUST00000178556 567 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm21258-201ENSMUST00000178673 567 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm21650-201ENSMUST00000179073 567 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm20937-201ENSMUST00000180329 567 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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