Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Myhas-202ENSMUST00000145021 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 AC122301.1-201ENSMUST00000219625 507 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm31711-201ENSMUST00000220687 196 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm34639-202ENSMUST00000223473 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Olfr716-201ENSMUST00000098137 1104 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Vpreb1P13372 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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