Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Gm26468-201ENSMUST00000158644 106 ntBASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Gm17047-201ENSMUST00000167709 430 ntBASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
P10404 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Gm42938-201ENSMUST00000198414 1072 ntBASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Gm43108-201ENSMUST00000200525 293 ntBASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Gm44380-201ENSMUST00000203125 293 ntBASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC6□□□□□ -1.45
P10404 0610006L08Rik-202ENSMUST00000206672 803 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Ldhc-204ENSMUST00000210585 1071 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
P10404 RMST_1.1-203ENSMUST00000217866 775 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Gm32443-201ENSMUST00000217880 707 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC6□□□□□ -1.45
P10404 AC139941.1-201ENSMUST00000221517 478 ntBASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC6□□□□□ -1.45
P10404 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC6□□□□□ -1.45
P10404 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Olfr916-201ENSMUST00000081196 933 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Gdpd4-201ENSMUST00000041860 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
P10404 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
P10404 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm40038-201ENSMUST00000197878 1370 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Rps8-ps3-201ENSMUST00000121011 650 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm15362-201ENSMUST00000121459 388 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Cylc2-203ENSMUST00000166749 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm20625-201ENSMUST00000177065 698 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm29259-201ENSMUST00000186396 694 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm28483-201ENSMUST00000189519 696 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm7496-201ENSMUST00000192573 1034 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
P10404 Gm32347-201ENSMUST00000192944 696 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms