Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 C230072F16Rik-203ENSMUST00000220322 1136 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm37212-201ENSMUST00000192582 3650 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm2602-201ENSMUST00000202112 571 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Apoa2-203ENSMUST00000111320 470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Apoa2-204ENSMUST00000111321 518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Gm340F6RGI3 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms