Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm10860-201ENSMUST00000176934 1888 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm16060-201ENSMUST00000153140 478 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Olfr1138-201ENSMUST00000099848 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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Usf3B2RUQ2 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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Usf3B2RUQ2 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Tas2r111-ps2-201ENSMUST00000203794 901 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Usf3B2RUQ2 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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