Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Sdr16c6-201ENSMUST00000095151 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 n-R5s65-201ENSMUST00000082614 117 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Kcnj15-204ENSMUST00000113856 5129 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms