Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 4930510E17Rik-201ENSMUST00000034550 1639 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm6913-201ENSMUST00000100019 348 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm42976-201ENSMUST00000200313 222 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm31897-201ENSMUST00000205924 340 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Vmn1r184-201ENSMUST00000057123 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Olfr867-201ENSMUST00000060780 996 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm12103-201ENSMUST00000121892 362 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Spocd1B1ASB6 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms