Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm17275-201ENSMUST00000181811 2550 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 AC154767.2-201ENSMUST00000224584 414 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Pls3-203ENSMUST00000114058 3032 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm19124-201ENSMUST00000191041 832 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Grik3B1AS29 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms