Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Olfr1270-205ENSMUST00000216354 4836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm11882-201ENSMUST00000121463 506 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm4856-201ENSMUST00000192696 1091 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm45910-201ENSMUST00000212493 1003 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 n-R5s65-201ENSMUST00000082614 117 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Olfr1261-204ENSMUST00000216953 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Olfr676-204ENSMUST00000219602 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CtcflA2APF3 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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