Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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Rnf4Q9QZS2 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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Rnf4Q9QZS2 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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Rnf4Q9QZS2 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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Rnf4Q9QZS2 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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Rnf4Q9QZS2 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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Rnf4Q9QZS2 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Rnf4Q9QZS2 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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