Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm23754-201ENSMUST00000157576 63 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr723-201ENSMUST00000164157 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm26179-201ENSMUST00000177723 132 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm37946-201ENSMUST00000192064 347 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 1700074A21Rik-201ENSMUST00000192404 346 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm38146-201ENSMUST00000194121 1293 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 D13Ertd608e-202ENSMUST00000195797 704 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr723-202ENSMUST00000206058 1078 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr194-201ENSMUST00000072608 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr798-201ENSMUST00000079810 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r43-201ENSMUST00000089418 1069 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm18604-201ENSMUST00000172535 558 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms