Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm22600-201ENSMUST00000157598 269 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Vmn1r237-201ENSMUST00000077301 950 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Tas2r146-ps1-201ENSMUST00000203065 934 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 4930401A07Rik-202ENSMUST00000216155 360 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Usp29Q9ES63 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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