Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Defa-ps12-201ENSMUST00000122353 193 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm23392-201ENSMUST00000157580 113 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Mir7011-201ENSMUST00000183768 73 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29999-202ENSMUST00000193554 671 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm30275-202ENSMUST00000198124 416 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43108-201ENSMUST00000200525 293 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44380-201ENSMUST00000203125 293 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44036-201ENSMUST00000204551 336 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 AC116502.1-201ENSMUST00000220989 291 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 AC159263.3-201ENSMUST00000223434 460 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1356-201ENSMUST00000061289 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 mt-Nd4l-201ENSMUST00000084013 297 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38212-201ENSMUST00000194081 2756 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14584-201ENSMUST00000118956 637 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13677-201ENSMUST00000120739 595 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1027-ps1-201ENSMUST00000122338 875 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Mir5100-201ENSMUST00000174993 64 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27942-201ENSMUST00000184669 101 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29475-201ENSMUST00000190767 312 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Cd69-203ENSMUST00000204411 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5339-201ENSMUST00000210551 1102 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 4930503E24Rik-202ENSMUST00000219657 942 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm32899-201ENSMUST00000219694 207 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 AC159256.1-201ENSMUST00000224298 1039 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 CT009539.1-201ENSMUST00000226465 220 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25189-201ENSMUST00000083911 164 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms